干細(xì)胞三維培養(yǎng)的優(yōu)點(diǎn)主要包括以下幾點(diǎn)：

更好地模擬細(xì)胞在體內(nèi)的生長(zhǎng)環(huán)境：三維培養(yǎng)能夠更緊密地模仿復(fù)雜的細(xì)胞組織間相互作用以及在體內(nèi)的微環(huán)境，為細(xì)胞生長(zhǎng)、分化提供了一個(gè)合適的微環(huán)境，并有在體外創(chuàng)造組織樣結(jié)構(gòu)的能力。

三維培養(yǎng)的干細(xì)胞呈現(xiàn)高核質(zhì)比，而且分化能力也顯著增強(qiáng)，趨化因子表達(dá)增加：這表明三維培養(yǎng)能夠促進(jìn)干細(xì)胞的活性和功能。

適合于干細(xì)胞的定向分化：通過(guò)模擬天然微環(huán)境中發(fā)現(xiàn)的胞外基質(zhì)、維度和空間梯度進(jìn)行細(xì)胞三維培養(yǎng)，不僅有助于擴(kuò)大和功能的改進(jìn)，而且適合于干細(xì)胞的定向分化。

增強(qiáng)MSCs干性：相關(guān)研究表明二維（傳統(tǒng)）干細(xì)胞培養(yǎng)不能復(fù)制真實(shí)的體內(nèi)微環(huán)境，導(dǎo)致干細(xì)胞在長(zhǎng)期培養(yǎng)過(guò)程中干性下降；而采用三維培養(yǎng)可導(dǎo)致部分MSCs干性強(qiáng)于二維培養(yǎng)。

易于規(guī)模化生產(chǎn)培養(yǎng)：三維培養(yǎng)模式多采用微球載體作為支架，結(jié)構(gòu)的組裝通過(guò)使用支架來(lái)實(shí)現(xiàn)，支架是一種微組織細(xì)胞支架，價(jià)格低廉，操作簡(jiǎn)單。

結(jié)合配套的生物反應(yīng)器，在一定程度上更容易地控制和監(jiān)測(cè)生長(zhǎng)細(xì)胞的微環(huán)境參數(shù)（溫度、通氣策略、pH和DO變化等）：同時(shí)借助在線活細(xì)胞監(jiān)測(cè)計(jì)數(shù)，減少取樣繁瑣和染菌風(fēng)險(xiǎn)，提高細(xì)胞產(chǎn)能和保證細(xì)胞質(zhì)量。

三維培養(yǎng)細(xì)胞增殖速度相對(duì)于二維培養(yǎng)可能更快或更慢，此增殖速度更接近體內(nèi)細(xì)胞的增殖速度。

三維培養(yǎng)能夠更好的模擬體內(nèi)細(xì)胞形態(tài)學(xué)和生理學(xué)：三維培養(yǎng)的細(xì)胞對(duì)藥物及理化刺激的反應(yīng)會(huì)更接近于體內(nèi)生理狀態(tài)下的細(xì)胞，能夠獨(dú)立評(píng)估微環(huán)境的不同特征來(lái)調(diào)節(jié)組織器官發(fā)生和疾病等。

三維細(xì)胞培養(yǎng)有助于我們對(duì)復(fù)雜的生物機(jī)制進(jìn)行研究：比如成骨細(xì)胞如何誘導(dǎo)為骨細(xì)胞，且這一研究過(guò)程是可重復(fù)的。

在需要進(jìn)行大批量細(xì)胞培養(yǎng)時(shí)，三維培養(yǎng)干細(xì)胞在空間、人工、試劑耗材與時(shí)間上的成本要遠(yuǎn)低于二維培養(yǎng)。